MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d plasmid pHPv225d

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017383	A	6	6	34	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017383	T	10	10	41	50	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017383	A	6	6	107	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017383	TAT	2	6	113	118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017383	TAGT	2	8	129	136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017383	A	7	7	140	146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017383	ATC	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017383	AGTT	2	8	281	288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017383	TCATT	2	10	3948	3957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017383	T	6	6	3980	3985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017383	A	7	7	4004	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017383	TAAA	2	8	4021	4028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017383	A	6	6	4026	4031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017383	GTC	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017383	AATC	2	8	5005	5012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017383	AT	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017383	A	6	6	5101	5106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017383	CTAA	2	8	5574	5581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017383	TG	3	6	5619	5624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017383	TGA	2	6	5654	5659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017383	CA	3	6	5705	5710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017383	AC	3	6	5747	5752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017383	TTGAT	2	10	5794	5803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017383	CTA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017383	ACA	3	9	5930	5938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017383	CAT	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017383	T	6	6	6050	6055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017383	CAAGG	2	10	6084	6093	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017383	TAC	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017383	CCA	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017383	GA	3	6	7317	7322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.